Seminario Cinbio: ”Analysis of endothelin-1 (EDN-1) UTR regions “
Hoy nuestro compañero del laboratio, Carlos López Solarat, ha impartido un seminario en el Centro de Investigación Biomédicas (Cinbio) de la Universidad de Vigo, titulado » Analysis of endothelin-1 (EDN-1) UTR regions «. En este seminario se expusieron los resultados de los experimentos realizados durante su trabajo fin de grado (TFG), donde analizo las regiones no codificantes ( 5′ y 3′ – UTR) del gen EDN-1 de 60 pacientes con Hypertensión Arterial Pulmonar (HAP), provenientes del Complejo hospital de Pontevedra (CHOP).
Tras este cribado, detectó dos mutaciones que posiblemente afectarían a la expresión de este gen, una delección en la región 5′-UTR y un SNP en la región 3′-UTR. Como ensayo confirmativo de las alteraciones que estas mutaciones generaban en la expresión de EDN-1, se realizó un ensayo de luciferasa, obteniendo una expresión diferencial 7,5 veces mayor que el control para la mutación en la región 3′ – UTR y un 30% de sobrexpresión en la mutación de la región 5′ – UTR.
Además, detectó mediante un análisis in silico, que estas mutaciones se encuentran en regiones de unión a varios factores de transcripción (VDR, PPRγ y KLF4). Con el fin de determinar empíricamente si estos factores de transcripción realmente se unen en esa región y si estas mutaciones provocan alteraciones en dicha unión, Carlos se encuentra optimizando una técnica de inmunoprecipitación de cromatina con amplificación por qPCR (CHiP-qPCR), que esperamos que de buenos resultados en un par de meses.